Universitat Internacional de Catalunya - BarcelonaInteracción de Biomoléculas
Lengua de impartición principal: castellano
Otras lenguas de impartición: catalán, inglés
Responsable
Dr. Jordi VILLÀ - jvilla@uic.es
Horario de atención
La interacción con el profesorado se realizará previa solicitud por correo electrónico: jvilla@uic.cat
Conocer cómo las biomoléculas interaccionan nos abre las puertas a entender mecanismos biológicos de creciente complejidad. En este curso, después de una breve introducción a las diferentes técnicas experimentales de estudio de las interacciones, usaremos una aproximación puramente bioinformática para analizar las particularidades de las interacciones de las biomoléculas y el estudio de las bases de datos existentes y finalizaremos con el uso de simulaciones moleculares y docking para entender con más detalle la base bioquímica y estructural de estas interacciones.
Hay que tener un buen fundamento de bioquímica y tener capacidad de entender, desarrollar y ejecutar herramientas de análisis bioinformática basadas en Python y R.
El objetivo central de esta asignatura es desarrollar un conocimiento holístico de las características de las interacciones entre moléculas de interés biológico (proteínas, ácidos nucleicos, metabolitos). En particular, en este curso, buscaremos:
Conocer la importancia de la información de interacción molecular y ser capaces de proporcionar ejemplos de diferentes tipos de interacción molecular.
Conocer las principales metodologías experimentales utilizadas para estudiar las interacciones proteína-proteína, así como sus virtudes y limitaciones.
Conocer y aprender a utilizar las bases de datos de interacciones moleculares.
Ejecutar y comprender metodologías de simulación molecular sencillas y de docking molecular.
General:
Específico:
Conocimiento avanzado del uso del repertorio existente de bases de datos de interacción de proteínas.
Capacidad de desarrollar herramientas computacionales en Python y R para el análisis de datos de interacción de biomoléculas.
Capacidad de realizar trabajos en equipo para producir y comunicar investigación científica.
La asignatura se divide en tres módulos.
Conferencias:
Interacción de biomoléculas
Fundamentos fisicoquímicos
Técnicas experimentales
Bases de datos de interacciones moleculares
Dinámica de las interacciones moleculares
Laboratorio:
Bases de datos de interacciones moleculares
El uso de simulaciones en el estudio de las interacciones moleculares
Docking
PBL:
Análisis y discusión de ejemplos reales de interacciones moleculares en biomedicina
Structural Bioinformatics 2nd Edition Jenny Gu; Philip E. Bourne ISBN-10: 0470181052
Molecular Driving Forces: Statistical Thermodynamics in Biology, Chemistry, Physics, and Nanoscience, 2nd Edition; Ken A. Dill ISBN-10: 9780815344308